幹細胞就像小魔術師：它們有能力轉化為許多不同的組織類型並促進損傷癒合。幹細胞在馬獸醫學中有多種用途，但最常用於幫助治療骨關節炎和肌腱炎等肌肉骨骼疾病。最近的研究還使用乾細胞治療蹄葉炎。

為了收穫幹細胞，從受影響的馬身上收集脂肪組織並送到實驗室，在那裡細胞被分離並放入新的培養物中。培養物被送回接受治療的獸醫，獸醫隨後將細胞注射回馬，通常是軟組織損傷或關節。

波蘭和德國的一項研究發現，從患有馬代謝綜合徵的馬身上採集的干細胞可能不如從健康馬身上採集的干細胞存活。這項研究緊隨人類再生醫學的研究之後，該研究表明，從肥胖患者或胰島素抵抗患者身上採集的干細胞不如從健康患者身上採集的干細胞存活。

弗羅茨瓦夫環境與生命科學大學的研究人員從六匹健康馬和六匹被診斷患有 EMS 的馬尾巴頭部附近的脂肪組織中分離出乾細胞。科學家們發現，與健康馬匹相比，患有 EMS 馬匹的干細胞存活和繁殖的可能性更小。此外，受 EMS 影響的馬的干細胞存在結構缺陷和線粒體受損（線粒體調節細胞代謝）。

來自患有 EMS 的馬的干細胞也積累了與氧化應激相關的有毒化合物，這可能導致細胞過早死亡。研究小組得出結論，在將馬的干細胞注射回馬體內之前，可能需要用 EMS 和抗氧化劑處理馬的干細胞。